Para dar pleno cumplimiento a sus objetivos, la SSF presenta una organización dividida en tres niveles: Consejo Directivo, Superintendente e Intendencias, y se apoyan en direcciones, departamentos y unidades, para el desenvolvimiento de la labor de fiscalización.

El Consejo Directivo es la máxima autoridad institucional. Es responsable de dictar normas prudenciales y contables de aplicación a las entidades bajo su supervisión, autorizar la constitución de bancos y sociedades de seguros, decretar intervenciones de las instituciones supervisadas, y emitir reglamentos internos, entre otras funciones.

El Consejo Directivo se conforma de un Presidente, que es a la vez el Superintendente, cuatro miembros propietarios, un presidente suplente y un secretario; estos dos últimos, son designados de su seno.

El nombramiento de los miembros propietarios del Consejo, con la excepción de su Presidente, se hace de ternas presentadas por la Corte Suprema de Justicia, el Banco Central de Reserva y los ministerios de Hacienda y de Economía, para escoger a un miembro por parte de cada entidad mencionada.

Los miembros del Consejo duran cinco años en sus funciones, pueden ser reelectos, y no pueden ser separados de sus cargos sino por decisión adoptada en Consejo de Ministros y con expresión de causa.

El Superintendente

El Superintendente del Sistema Financiero es el Presidente del Consejo Directivo. Es responsable de ejecutar las resoluciones emanadas del Consejo, y tiene a su cargo la dirección superior de las actividades de la Superintendencia.

El Superintendente es nombrado por el Consejo de Ministros a propuesta del Presidente de la República, por un período de cinco años.

Existen dos Intendencias: la de Supervisión y la Jurídica. La de Supervisión mantiene una constante supervisión integral de las entidades que están sujetas a la fiscalización por parte de la SSF.

La Intendencia Jurídica da asesoría a las autoridades y dependencias de la SSF, para el adecuado cumplimiento de las leyes y el orden normativo aplicable a la institución, así como a las entidades fiscalizadas.

Apoyo a la supervisión

La Intendencia de Supervisión se apoya en departamentos, que fortalecen y realizan las labores propias de la Intendencia.

Estos departamentos son; Inspección de Campo, Inspección de Riesgos, Seguros, Entidades Financieras no Bancarias, Análisis Financiero, Normativa, Auditorías Especiales y la Unidad Central de Información.

La SSF tiene tres unidades de apoyo. La Dirección de Administración y Finanzas coordina el empleo de los recursos humanos, financieros, materiales y técnicos de la institución.

La Dirección de Informática, facilita el uso de la tecnología para proveer a los usuarios la información y seguridad de la misma en el desarrollo de sus funciones, ha elaborado un sistema de comunicación para el envío y recepción de datos de y hacia las diferentes entidades supervisadas por la SSF.